原莆田秀屿港口岸和泉州肖厝港口岸同处湄洲湾水域，于1995年12月26日经国务院同一份文件批复对外开放（国函[1995]133号），1999年12月同时通过国家级验收，国家交通部同时公布对外开放（交函海[1999]356号）。根据《海峡西岸经济区沿海港口布局规划》，莆田港划分为秀屿、东吴、兴化湾南岸等3个港区，其中，秀屿港区已对外开放，开放水域范围和岸线依据国务院批复(国函[1995]133号)和中国人民解放军三七五○三部队司令部《关于湄洲湾秀屿港(含湄洲岛客运码头)、肖厝港对外国籍船舶开放意见的函》([1998] 司作字第031号)标定。

一、开放水域

湄洲湾开放水域与泉州港口岸肖厝、斗尾港区开放水域范围相同（见莆田港口岸秀屿港区（含湄州湾客运码头）开放范围图），湾内秀屿码头一侧的以下四点连线内的水域为航行管制区：

北纬25°12′18″，东经118°59′02″

北纬25°12′35″，东经118°59′24″

北纬25°13′30″，东经118°58′21″

北纬25°13′01″，东经118°57′40″

湄洲岛客运码头的开放水域范围为以下四点连线及自然岸线围成的水域：

鹅冠角：北纬25°01′40″，东经119°07′16″

采屿：北纬25°02′14″，东经119°04′16″

螺港礁：北纬25°04′42″，东经119°04′11″

湄洲：北纬25°04′56″，东经119°06′12″

二、开放岸线

秀屿段：石头鼻（北纬25°16′06″，东经118°59′25″）至莆头（北纬25°13′42″，东经118°58′21″）至秀屿A点（北纬25°12′59″，东经118°59′00″）至秀屿B点（北纬25°12′42″，东经118°59′24″）至龙虎屿（北纬25°12′14″，东经119°00′12″）至前云（北纬25°12′48″，东经119°00′21″）至栖梧（北纬25°13′52″，东经119°03′18″）至安柄（北纬25°12′59″，东经119°04′00″）至塔林A点（北纬25°10′33″，东经119°01′53″）

东吴段：塔林A点（北纬25°10′33″，东经119°01′53″）至塔林B点（北纬25°09′46″，东经119°01′11″）至西亭（北纬25°07′50″，东经119°01′25″）

罗屿岛（北纬25°11′10.8″，东经119°00′43.3″）环岛岸线

湄洲岛段：鹅尾山东侧 (北纬25°01′40″，东经119°07′16″)至湄州(北纬25°04′56″，东经119°06′12″)自然岸线

三、开放码头、泊位、锚地、浮筒

（一）码头7个，泊位7个

1. 秀屿多用途码头：5万吨级泊位1个

2. 秀屿杂货码头：1万吨级泊位1个

3. 秀屿集装箱码头：3千吨级泊位1个

4. 中原化工码头：3千吨级泊位1个

5.湄洲湾火电厂专用码头：8千吨级煤炭泊位1个

6.湄洲岛对台客运码头：3千吨级泊位1个

7.湄洲岛轮渡码头：0.3千吨级泊位1个

（二）浮筒4个

1.北纬25°12′34″，东经118°58′52″（5万吨系船浮筒）

2.北纬25°12′52″，东经118°58′41″（2.5万吨系船浮筒）

3.北纬25°12′46″，东经118°58′22″（1万吨系船浮筒）

4.北纬25°07′45″，东经119°00′57″（湄洲湾电厂过驳浮筒）

湄洲湾公用锚地9个

1.引航检疫锚地。在以下四点连线水域内

北纬25°03′48″，东经119°02′42″

北纬25°03′48″，东经119°03′24″

北纬25°02′18″，东经119°03′48″

北纬25°02′18″，东经119°03′06″

2.大型船舶锚地。在以下四点连线水域内

北纬25°02′30″，东经119°02′06″

北纬25°02′30″，东经119°02′45″

北纬25°00′39″，东经119°03′12″

北纬25°00′39″，东经119°02′24″

3.湄洲湾火电厂煤船过驳专用锚地。以北纬25°07′18″，东经119°00′34″为圆心，半径350米以内水域

4.货船锚地。在以下四点连线水域内

北纬25°07′08.5″，东经119°00′23″

北纬25°07′14.5″，东经119°00′58″

北纬25°06′21″，东经119°00′32.5″

北纬25°06′28″，东经119°01′17.5″

5.货船锚地。在以下四点连线水域内

北纬25°10′00″，东经118°59′24″

北纬25°10′00″，东经119°00′06″

北纬25°09′00″，东经119°00′06″

北纬25°09′00″，东经118°59′45″

6.成品油船锚地。在以下四点连线水域内

北纬25°04′51.5″，东经119°00′22.1″

北纬25°03′46″，东经119°00′22.1″

北纬25°04′51.5″，东经118°58′30″

北纬25°03′46″，东经118°58′30″

7.成品油船锚地。在以下四点连线的水域内

北纬25°09′00.5″，东经118°58′46″

北纬25°09′02.5″，东经118°59′20″

北纬25°07′34.5″，东经118°58′52″

北纬25°07′35.5″，东经118°59′51″

8.剑屿避风锚地。在以下四点连线水域内

北纬24°58′05″，东经119°00′25″

北纬24°58′24″，东经119°00′51.5″

北纬24°57′46.5″，东经119°00′41″

北纬24°58′04″，东经119°01′06.5″

9.引航检疫锚地。以北纬25°01′12″，东经119°05′18″为圆心，半径550米以内水域