以通关现场型和属地管理型并重的基层海关，辖区范围包括莆田市全境。1993年12月18日，正式对外开展海关业务，并揭牌。

主要职能：认真贯彻《海关法》和国家、海关总署的政策法规；按照“依法行政，为国把关，服务经济，促进发展”的海关工作方针，实施对莆田市进出境货物、物品、运输工具及其人员携带物品的监督管理；征收关税和其他税费；查缉走私、编报海关统计;组织开展精神文明建设和思想政治工作；加强同各海关的联系配合；办理福州海关交办的各项工作。

内设机构：办公室、通关科、物流监控科、加工贸易监管科、稽查科、行财科、人事政工科、驻秀屿办事处、驻秀屿港办事处、驻湄洲岛办事处

联系方式

地址：莆田市城厢区文献西路1588号  邮编：351100

总机：0591－2690000